Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AY761185Q5ERI8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AY761185Q5ERI8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms