Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms