Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clpsl2Q3UW21 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms