Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
D130052B06RikQ3UW13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms