Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BB287469Q3UT53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms