Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmed8Q3UHI4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed8Q3UHI4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms