Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zswim8Q3UHH1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms