Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc10a4Q3UEZ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms