Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc174Q3U155 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms