Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem35bQ3U0Y2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms