Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms