Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jsrp1Q3MI48 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Jsrp1Q3MI48 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Jsrp1Q3MI48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Jsrp1Q3MI48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Jsrp1Q3MI48 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms