Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne9Q1RLL3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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