Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK1Q15118 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms