Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VgfQ0VGU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VgfQ0VGU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms