Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NeblQ0II04 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NeblQ0II04 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms