Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms