Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Calb2Q08331 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms