Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou6f1Q07916 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou6f1Q07916 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms