Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AmbpQ07456 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms