Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarcad1Q04692 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarcad1Q04692 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarcad1Q04692 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms