Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp11Q02853 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms