Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp41Q02526 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp41Q02526 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms