Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcd1Q02242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdcd1Q02242 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms