Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcqQ02111 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms