Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SelpQ01102 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelpQ01102 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms