Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms