Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms