Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Loxl1P97873 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Loxl1P97873 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms