Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx2P81066 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms