Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad54lP70270 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms