Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba52P62984 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba52P62984 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uba52P62984 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms