Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl39P62892 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39P62892 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms