Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rps28P62858 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms