Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg6P61406 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg6P61406 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smg6P61406 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg6P61406 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg6P61406 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smg6P61406 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms