Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPI1P60174 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPI1P60174 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPI1P60174 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPI1P60174 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPI1P60174 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPI1P60174 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPI1P60174 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPI1P60174 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms