Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh5P55284 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh5P55284 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms