Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB27AP51159 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms