Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd7P50283 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd7P50283 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms