Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx2-1P50220 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-1P50220 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms