Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mcm4P49717 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcm4P49717 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.8 ms