Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbx2P48031 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms