Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-5P42582 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-5P42582 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms