Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pik3caP42337 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pik3caP42337 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms