Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
APOBEC1P41238 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms