Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprkP35822 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprkP35822 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprkP35822 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprkP35822 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprkP35822 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprkP35822 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprkP35822 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprkP35822 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms