Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Stfa3P35173 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms