Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp12P34960 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp12P34960 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms