Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc1P34928 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc1P34928 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms