Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc3P33622 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc3P33622 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms